MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Ammonifex degensii KC4 chromosome

Total Repeats: 6074

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_013385	GA	3	6	186776	186781	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
502	NC_013385	TCC	2	6	189582	189587	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
503	NC_013385	AGGG	2	8	189620	189627	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
504	NC_013385	CTTCAA	2	12	189652	189663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
505	NC_013385	CCTG	2	8	189787	189794	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
506	NC_013385	GGT	2	6	189856	189861	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
507	NC_013385	CGG	2	6	189889	189894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
508	NC_013385	GGTCG	2	10	190092	190101	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
509	NC_013385	AGGA	2	8	190118	190125	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
510	NC_013385	AGA	2	6	190200	190205	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
511	NC_013385	AAT	2	6	190213	190218	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
512	NC_013385	AGG	2	6	190231	190236	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
513	NC_013385	G	6	6	191371	191376	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
514	NC_013385	AAGC	2	8	191381	191388	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
515	NC_013385	G	6	6	192570	192575	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
516	NC_013385	GGC	2	6	193705	193710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
517	NC_013385	CGA	2	6	193752	193757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
518	NC_013385	GGGT	2	8	193761	193768	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
519	NC_013385	GGAGC	2	10	195933	195942	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
520	NC_013385	GA	3	6	195964	195969	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
521	NC_013385	CTT	2	6	196176	196181	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
522	NC_013385	GCG	2	6	196184	196189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
523	NC_013385	TGG	2	6	196243	196248	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
524	NC_013385	T	6	6	196258	196263	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_013385	CCTGTT	2	12	196300	196311	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
526	NC_013385	GGA	2	6	196332	196337	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
527	NC_013385	AGGCA	2	10	196364	196373	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
528	NC_013385	G	6	6	203122	203127	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
529	NC_013385	GAA	2	6	203193	203198	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
530	NC_013385	AGGG	2	8	203669	203676	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
531	NC_013385	AGC	2	6	203681	203686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
532	NC_013385	ATAAC	2	10	205429	205438	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
533	NC_013385	AG	3	6	205442	205447	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
534	NC_013385	AAAG	2	8	205495	205502	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
535	NC_013385	AGG	2	6	205561	205566	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
536	NC_013385	CACC	2	8	205568	205575	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
537	NC_013385	CG	3	6	205618	205623	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
538	NC_013385	GC	3	6	205636	205641	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
539	NC_013385	AGG	2	6	205653	205658	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
540	NC_013385	CCCT	2	8	207759	207766	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
541	NC_013385	T	6	6	207779	207784	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
542	NC_013385	TAC	2	6	207802	207807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
543	NC_013385	TAA	2	6	207844	207849	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
544	NC_013385	ATC	2	6	210900	210905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
545	NC_013385	CTTT	2	8	212829	212836	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
546	NC_013385	AGCA	2	8	212883	212890	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
547	NC_013385	GAGAG	2	10	215700	215709	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
548	NC_013385	TGGG	2	8	216793	216800	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
549	NC_013385	AG	3	6	216818	216823	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
550	NC_013385	ACC	2	6	216867	216872	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
551	NC_013385	GTA	2	6	216974	216979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
552	NC_013385	TCG	2	6	217059	217064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
553	NC_013385	CTT	2	6	217096	217101	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
554	NC_013385	CTGC	2	8	217104	217111	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
555	NC_013385	AGC	2	6	217122	217127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
556	NC_013385	GA	3	6	217141	217146	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
557	NC_013385	AGG	2	6	217181	217186	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
558	NC_013385	AG	3	6	217295	217300	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
559	NC_013385	AGAAGG	2	12	217448	217459	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
560	NC_013385	GCG	3	9	217518	217526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
561	NC_013385	TGG	2	6	217531	217536	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
562	NC_013385	AGG	2	6	217594	217599	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
563	NC_013385	GAGGC	2	10	217600	217609	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
564	NC_013385	T	7	7	217688	217694	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
565	NC_013385	GAGG	2	8	217703	217710	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
566	NC_013385	CCG	2	6	217729	217734	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
567	NC_013385	CGGA	2	8	217771	217778	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
568	NC_013385	GGT	2	6	217815	217820	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
569	NC_013385	GAG	2	6	217821	217826	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
570	NC_013385	CTC	2	6	217864	217869	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
571	NC_013385	TCC	2	6	217903	217908	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
572	NC_013385	AGGG	2	8	217941	217948	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
573	NC_013385	CTTCAA	2	12	217973	217984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
574	NC_013385	T	6	6	218055	218060	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
575	NC_013385	AG	3	6	218127	218132	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
576	NC_013385	AGG	3	9	218155	218163	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
577	NC_013385	CTC	2	6	218210	218215	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
578	NC_013385	GTT	2	6	218260	218265	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
579	NC_013385	GGC	2	6	218301	218306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
580	NC_013385	GGT	2	6	218313	218318	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
581	NC_013385	TG	3	6	218363	218368	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
582	NC_013385	AGG	2	6	218372	218377	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
583	NC_013385	GCC	2	6	218399	218404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
584	NC_013385	GAG	2	6	218558	218563	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
585	NC_013385	AGG	2	6	219472	219477	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
586	NC_013385	TAA	2	6	229335	229340	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
587	NC_013385	AGGG	2	8	229354	229361	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
588	NC_013385	G	6	6	229359	229364	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
589	NC_013385	CGG	2	6	230842	230847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
590	NC_013385	GGCA	2	8	230891	230898	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
591	NC_013385	TTG	2	6	230936	230941	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
592	NC_013385	CGG	2	6	230960	230965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
593	NC_013385	GCG	2	6	230971	230976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
594	NC_013385	TCCCT	2	10	233457	233466	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
595	NC_013385	CCT	2	6	233988	233993	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
596	NC_013385	AT	3	6	234018	234023	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
597	NC_013385	GTT	2	6	234038	234043	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
598	NC_013385	GAG	2	6	234078	234083	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
599	NC_013385	A	6	6	234085	234090	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
600	NC_013385	AG	3	6	234094	234099	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
601	NC_013385	AGG	2	6	234147	234152	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
602	NC_013385	GGA	2	6	234229	234234	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
603	NC_013385	GAG	2	6	234257	234262	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
604	NC_013385	CTGG	2	8	234360	234367	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
605	NC_013385	GGA	2	6	234378	234383	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
606	NC_013385	TGG	2	6	234486	234491	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
607	NC_013385	AGA	2	6	234541	234546	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
608	NC_013385	GTG	2	6	234615	234620	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
609	NC_013385	ACC	2	6	234670	234675	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
610	NC_013385	AAG	2	6	234743	234748	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
611	NC_013385	ACCT	2	8	234753	234760	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
612	NC_013385	AGA	2	6	234788	234793	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
613	NC_013385	TAC	2	6	234828	234833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
614	NC_013385	GAG	2	6	234891	234896	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
615	NC_013385	ATCT	2	8	234924	234931	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
616	NC_013385	GA	3	6	235060	235065	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
617	NC_013385	GTG	2	6	235084	235089	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
618	NC_013385	GCG	2	6	235122	235127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
619	NC_013385	AGGC	2	8	235128	235135	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
620	NC_013385	GGA	2	6	235150	235155	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
621	NC_013385	GTC	2	6	235286	235291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
622	NC_013385	GGCGAA	2	12	235346	235357	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
623	NC_013385	GGAG	2	8	235393	235400	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
624	NC_013385	GAG	3	9	235437	235445	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
625	NC_013385	TCT	2	6	235556	235561	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
626	NC_013385	GCG	2	6	237899	237904	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
627	NC_013385	T	6	6	239561	239566	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
628	NC_013385	AGA	2	6	239602	239607	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
629	NC_013385	TCA	2	6	241270	241275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
630	NC_013385	GGCA	2	8	242062	242069	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
631	NC_013385	AAAG	2	8	242086	242093	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
632	NC_013385	AGG	2	6	245711	245716	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
633	NC_013385	GGC	2	6	248719	248724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
634	NC_013385	GAG	2	6	248786	248791	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
635	NC_013385	GCT	2	6	249618	249623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
636	NC_013385	GCG	2	6	249632	249637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
637	NC_013385	AGA	2	6	249638	249643	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
638	NC_013385	TTC	2	6	249650	249655	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
639	NC_013385	CTT	2	6	249663	249668	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
640	NC_013385	T	7	7	249667	249673	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
641	NC_013385	AGG	2	6	253461	253466	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
642	NC_013385	CGT	2	6	260758	260763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
643	NC_013385	GAAGT	2	10	260776	260785	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
644	NC_013385	CCT	2	6	260847	260852	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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647	NC_013385	CTCC	2	8	262225	262232	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
648	NC_013385	GACCA	2	10	262315	262324	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
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651	NC_013385	G	6	6	262505	262510	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
652	NC_013385	GCC	3	9	262555	262563	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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654	NC_013385	CCT	2	6	264128	264133	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
655	NC_013385	TACC	2	8	264135	264142	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
656	NC_013385	TCCT	2	8	264154	264161	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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662	NC_013385	GC	3	6	264472	264477	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
663	NC_013385	GAG	2	6	264503	264508	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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675	NC_013385	CTG	2	6	265119	265124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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679	NC_013385	CTT	2	6	265241	265246	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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682	NC_013385	GAA	2	6	266430	266435	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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686	NC_013385	CGG	2	6	266646	266651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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688	NC_013385	GGT	2	6	266703	266708	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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910	NC_013385	GCA	2	6	348312	348317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
911	NC_013385	GCGCAA	2	12	348318	348329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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